报告题目一：PCGIMA: Position-defined CGI methylation analysis

主讲人：章乐

主办单位：人工智能学院

讲座时间：2022年11月9日下午14:30-16:00

讲座形式：腾讯会议：421-956-113

内容简介：

 CpG岛（CGI）甲基化是基因表达调控和染色体完整性的关键表观遗传学机制之一。然而，经典的CGI预测方法既不容易定位那些短的和位置敏感的CGI，也很难从全基因组角度研究不同CpG位置和间隔参数下CGI的遗传和表达模式。因此，我们迫切需要开发这样一种生物信息学算法，不仅可以定位短而位置敏感的CGI，还可以提供CGI甲基化位点注释和功能分析，以研究CGI甲基的调控机制。因此，本研究开发了人类基因组位置定义的CGI预测方法，利用高性能计算来定位短的和位置敏感的CGI，然后建立了一种新的人类基因组注释和分析方法，以研究CGI、基因表达和甲基化之间的联系。最后，我们将这些功能集成到了PCGIMA网站中，以提供相关的在线计算和可视化服务。主要结果包括：（1）与以前的CGI预测方法相比，人类位置定义的CGI方法更有效地预测具有多个连续（d）值的位置定义CGI，并定位更多潜在的短CGI。（2） 我们的注释和分析方法不仅可以从全基因组的角度研究位置定义的CGI甲基化和基因表达特异性之间的关系，而且可以分析位置定义CGI与基因功能的潜在关联。（3） PCGIMA为人类CGI预测和甲基化提供了一个易于使用的分析和可视化平台。

主讲人简介：

章乐，国家千人计划（青年项目），四川学术与技术带头人和四川千人计划获得者, 现任四川大学计算机学院教授，副院长，博士生导师。中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会副理事长， ACM SIGBIO 中国区副主席，重庆生物信息学会副理事长。先后以第一完成人荣获四川省科技进步二等奖、重庆科技进步三等奖、吴文俊人工智能二等奖和中国产学研合作创新成果优秀奖在内的多项学术荣誉。

报告题目二：三支类指定属性约简

主讲人：马希骜

主办单位：人工智能学院

讲座时间：2022年11月9日下午16:00-17:30

讲座形式：腾讯会议：421-956-113

内容简介： 

三支决策理论为粗糙集中正域、边界域和负域提供了新的解释。从正域、边界域和负域可以分别构造接受、不承诺和拒绝规则。类指定属性约简涉及用于构建此类规则的最小属性集。本次报告将介绍三支类指定属性约简。我们研究了三种类指定属性约简包括基于正域的、基于负域的和基于正负域的属性约简以及这三种类指定属性约简之间的关系。通过将其推广到概率框架下，我们研究了概率粗糙集模型中的三种类指定属性约简及其关系。

主讲人简介：

马希骜，博士，副教授，硕士生导师，2014年毕业于西南交通大学，获工学博士学位（计算机应用专业），在加拿大里贾纳大学计算机系进行了为期两年的博士后研究工作。主要研究方向为粗糙集、粒计算、三支决策、机器学习和数据挖掘等。近年来以第一作者在Information Sciences、International Journal of Approximate Reasoning、International Journal of Machine Learning and Cybernetics、Soft Computing等国际期刊上发表SCI检索论文9篇，其中ESI高倍引论文1篇。作为项目负责人主持国家自然科学基金青年项目一项，主持浙江省自然科学基金一项，主持重庆市自然科学基金一项，获得重庆市自然科学技术一等奖一项。